Administrativní komise VŠEM působí jako poradní orgán v administrativních oblastech VŠEM.

Akademická rada VŠEM působí jako koncepční, iniciativní a poradní orgán ve stanovených oblastech činnosti VŠEM.

Projednává disciplinární a administrativní přestupky a nekázeň studentů.

Kolegium rektora VŠEM je iniciačním a poradním orgánem VŠEM.

Zaměřuje se na evaluaci výsledků VŠEM v pedagogické, vzdělávací, studijní, technicko-organizační a výzkumné činnosti.

Jedná na podnět daný rektorem v řízení o vyslovení neplatnosti vykonání státní závěrečné zkoušky nebo její součásti.

Rektorát je výkonným orgánem VŠEM, který zajišťuje organizační, koordinační, konzultačně-poradní, evidenční a kontrolní činnost.

Provádí revize hodnocení písemných prací (seminární/zápočtové/praktické), hodnocených stupněm „nevyhověl“.

Rada pro vědu a výzkum VŠEM působí jako poradní orgán ve stanovených oblastech činnosti VŠEM.

Studentská rada VŠEM je samosprávným orgánem VŠEM (studenti a absolventi VŠEM).

Samosprávný orgán akademické obce VŠEM (studenti). Zástupci jsou voleni studenty na základě voleb, dle Jednacího řádu Studentského senátu VŠEM.